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國內超過10年沒有再傳羊痘案例，經過專家會議評估，農委會今（23）日宣布112年元旦起，國內羊隻全面停打羊痘疫苗，半年後進行一次全國地毯式臨場訪視，預計9月填報向世界動物衛生組織（WOAH）聲明我國為羊痘非疫國的資料，10月正式向WOAH聲明我國為羊痘非疫國。停打羊痘疫苗可節省疫苗施打成本，也有助育成率的提高，產業都相當期待。
臺灣自1977年開始規模養殖草蝦，創下「養蝦王國」的美譽，期間產量與出口產值位居世界之首，但產業因未注意疫病風險管控，加上長久以來養殖用水的供排水路設計規畫不夠完善，進排水並未妥善分離，一旦有疫病發生，極易造成區域內快速傳染與擴散，讓產業發展陷入困境。
非洲豬瘟近年於全球迅速蔓延，尤其去年在中國爆發疫情以來，亞洲各國無不繃緊神經嚴防入侵。為了監控我國豬隻及產品的邊境防疫，家畜衛生試驗所國家動物傳染病檢驗實驗室建立了非洲豬瘟的診斷及鑑定方法，並協助我國邊境管制的採樣檢驗。
距離臺灣拔針後一年、可向OIE申請非疫國的期限只剩2個月，家衛所6日報告國內口蹄疫防疫狀況，傳出好消息！截至108年4月29日，以口蹄疫中和抗體及非結構蛋白抗體監測，在肉品市場及養豬場等環境隨機檢測，均無陽性案例；野豬監測也無任何口蹄疫病毒檢出。農委會副主委黃金城表示，最快7月就可以向OIE申請口蹄疫疫區除名。
6日農委會家畜衛生試驗所協同國內農畜校系，舉辦非洲豬瘟及口蹄疫檢疫研討會。在非洲豬瘟部分，家衛所分別就實驗室檢疫技術與流程，以及檢疫現況進行報告，現已擬定實驗室檢驗流程，未來若有疫情發生，第一時間即可掌握疑似病例及擴大檢疫能量。口蹄疫方面，目前在畜牧場、肉品市場及野豬監測上，均無異常，最快可在7月向OIE申請成為口蹄疫非疫國，109年臺灣可望正式自口蹄疫疫區名單除名。
臺灣鴨隻年產值達80多億，時序入冬，除了防範禽流感，還有兩種讓鴨農聞之喪膽的疾病：鴨病毒性肝炎、水禽小病毒感染症，一旦染病，1週齡內小鴨死亡率高達95%。農委會家畜衛生試驗所今發表新型的「水禽病毒性疾病多價卵黃抗體製劑」，可有效控制上述兩種病，預期可降低死亡率達30%以上。
臺灣豬飼料原物料幾乎全為進口，面對非洲豬瘟的威脅，有專家提醒注意豬飼料中以由豬血製成的營養添加物「血漿蛋白」所帶來的疫病傳播風險。中國在爆發非洲豬瘟後，已於9月中旬全面禁止血漿蛋白用於製造飼料，農委會則表示，目前臺灣進口的血漿蛋白來源為美國、加拿大，不只來自非疫區，還要經過現場查廠才能輸入，風險控管嚴格。
2013年臺灣打破52年無病例的紀錄，重回狂犬病疫區。隔年，農委會家畜衛生試驗所（下稱畜衛所）與法國南錫（Nancy）狂犬病參考實驗室合作研究狂犬病防疫。在法方輔導下，畜衛所今成立「亞洲狂犬病診斷能力比對中心」，為法國以外全球唯一分部，未來將負責提供亞太地區狂犬病實驗室的檢驗樣本，協助各實驗室測試、維持儀器檢驗敏感度、確保檢驗人員正確操作實驗，提升狂犬病防疫強度。
防檢局今（27）日表示，本(5)月25日凌晨接獲臺北市家禽批發市場附設屠宰場獸醫師通報，在執行屠宰衛生檢查過程中發現有雞隻屠體疑似感染禽流感，即通報台北市動物保護處至現場採樣