原本作為寵物的綠鬣蜥，近年在野地裡大量繁殖，政府要求飼主要登記，也積極推動野外綠鬣蜥的移除計畫，綠鬣蜥雖然因為嚴重影響臺灣本土生態需要被移除，但有人以鞭炮炸牠、拿箭射牠，讓動保人士看不下去，要求政府制止虐待動物行為，並落實源頭管理。農委會林務局表示，從源頭管理很重要，原本禁止輸入動物的黑名單只有501種，今年將盤點禁止進口種類並更新黑名單，數量可能多達2,500種。
立委林淑芬與台灣動物社會研究會共同主辦「外來入侵種動物移除人道規範」座談會，倡議政府在移除外來入侵種動物時，必須兼顧人道，希望能遏止虐待外來種動物的行為。人道移除外來種動物的起因，是有人將鞭炮塞進已被五花大綁的綠鬣蜥的嘴巴裡，並炸死牠，也有人拿箭射穿綠鬣蜥，在移除綠鬣蜥的同時，出現各種虐待動物行為，動保團體指出，地方政府鼓勵獵捕綠鬣蜥後，各種虐殺亂象頻生，政府應該設法遏止。
鬣蜥聯盟社團管理員趙嘉宓說，林務局開放飼主登記時間太短，在截止登記後，原本就有飼養綠鬣蜥的人，撿到綠鬣蜥想收養牠，卻已無法再登記，他們希望林務局可以再設法開放讓他們登記收養，有些民間團體也有收容綠鬣蜥的意願，但目前都沒有管道。
農委會林務局保育組長羅尤娟回應表示，在移除外來時，林務局心裡也充滿忐忑，每個生命都有價值，但為了臺灣整體的生態，不得不移除外來種，也希望以人道及痛苦最小的方式處理，綠鬣蜥的野外族群不能再擴大，否則可能造成其他生命的犧牲，現在中央及地方都在積極進行移除工作，確實無力規劃收容這些綠鬣蜥。
有關飼主管理的部分，羅尤娟說，當初公告飼主登記飼養綠鬣蜥的時間有3個月，如果民眾錯失登記機會，後續願意了解情況並做處理，同時，林務局未來可能對已經登記的綠鬣蜥個體植入晶片，透過晶片管理已登記的綠鬣蜥流向，檢視飼主是否有好好照顧，如果發現綠鬣蜥被棄養，就可以從晶片回追飼主，對飼主進行較高強度的管理。
不過，虐待綠鬣蜥的部分，法規管理上可能有缺口。羅尤娟說，野保法以保育野生動物為主，規範保育類野生動物或是保育區內的一般動物不被虐待，非保育類及非保育區內的動物就不在規範內，綠鬣蜥如果不在保育區內，野保法就無能為力了。
動物保護法是否可以遏止虐待綠鬣蜥，恐怕也有困難，動保主管機關農委會畜牧處副處長江文全表示，動保法的適用對象是指犬貓及有人管理的脊椎動物，動保法第6條雖有規定，任何人不得騷擾、虐待或是傷害動物，但實務上司法判決動保法適用對象從嚴認定，至於有無修法的可能，江文全說，動保法的意旨是保護動物，有任何進步性的建議，畜牧處會尊重各界意見。
有逸逃之虞且可能在臺灣野外環境繁殖、壯大族群，進一步危害臺灣本地生態的物種，根本就不該開放進口，羅尤娟說，102年曾送請國貿易公告禁止輸入動物共計501種物種，今年已在盤點此禁止輸入物種的黑名單，將擴大限縮可能成為入侵物種的輸入，數量將擴增至2,500種，從源頭嚴格管理外來物種。
