經濟動物生產對於效率提升有較高的要求，農委會畜產試驗所應用全基因體晶片針對「節糧蛋種鴨」進行基因型鑑定，建構選種模式，以節省飼養空間、費用及人力，可縮短40%選育期程，大幅提升節糧蛋種鴨選拔效率。
畜試所2018年選育完成並命名的「褐色菜鴨高飼效品系」，具有高產蛋、蛋重大、蛋殼強度佳等特性，畜試所認為，褐色菜鴨高飼效品系可作為高飼效純系育種，或作為民間褐色菜鴨雜交生產商用蛋鴨的種原之用。
傳統選育優良品種必須經過數年，得從量體重、測蛋重等基礎著手，再整理收集到的性能數據及系譜，計算出育種價（值），並根據育種價值挑選蛋種鴨，傳統作法需要很長時間才能收到集到有用的數據。
畜試所系主任張怡穎表示，現在利用晶片選種模式，「雛鴨抽血，萃取DNA後就能跑晶片，看基因型，也能確認系譜資訊」，可以省下等待雛鴨長大才能做檢定的時間。
近年來因為氣候變遷加劇，畜牧業者也在準備因應之策，畜試所觀察到種鴨業者選育自有品系的意願逐漸提升，但沒有長時間維持系譜及系統化檢定的足夠能力，因此畜試所建構節糧蛋種鴨全基因體晶片選種模式，方便估算個體基因體育種價，未來規劃與產業、學界合作，進一步進行基因標記篩選，在考量種鴨場的營運模式下，進行晶片選種的優化，讓種鴨業者應用於自行選拔自家節糧蛋種鴨，提升生產效率。
運用晶片選種，種鴨場將可更快選育出自有節糧品系，圖為褐色菜鴨高飼效品系。（圖片提供／畜試所宜蘭分所）
根據畜試所試驗，無論在褐色菜鴨高飼效品系或是對照品系，以基因體育種價挑選的種鴨，可完全排除殘差飼料採食量相關性狀在50%後段班的種鴨，且應用晶片選種，在雛鴨階段完成基因型鑑定及基因體育種價估算後，即可篩選出要保留的種鴨，淘汰不想保留的個體，可節省飼養空間、飼料費用等。
畜試所評估，以傳統選拔褐色菜鴨高飼效品系需耗時6年，導入晶片輔助選種可縮減至3.5年，縮短約40%的選育期程。
畜牧生產及飼料大宗原料運輸等占溫室氣體排放量18%，飼料中主要的玉米及大豆粕成本也深受氣候狀況影響，若價格波動幅度大，不利於農民生產成本的控制，畜試所認為，育種才能有助於對抗極端氣候帶來的各種挑戰。
