可可樹是熱帶果樹，屏東是國內種植可可樹的大本營，而且發展出完整的巧克力產業鏈。農民若要新植可可樹，通常是以播種方式育苗，但因為可可種子外的果肉會緊緊黏住種子，若直接播種將很難控制發芽的速度，速度快的只要3天就發芽，慢的話可以拖到1個月，農委會種苗改良繁殖場找出可可種子育苗標準作業流程，快速去除果肉、保持種子適當濕度、貯放溫度，以及選擇有深度的盆器，即可讓可可種子發芽發得齊、苗也能長得齊。
種苗場屏東種苗研究中心助理研究員周佳霖說，可可種子外皮因為裹覆一層黏膩且高糖度的果肉，育苗時常造成微生物滋生而影響可可苗發育，摘下果實後迅速去除果肉很重要，測試過各種方法，使用果膠分解酵素浸泡5分鐘，就能加速果肉分解、快速搓掉果肉，降低微生物汙染機率。同時，種子上的果肉清乾淨，也有助於整齊化發芽速率，如此長出來的苗，高度一致，管理上較為方便。
可可的成熟果果實剖面。（圖片提供／種苗場周佳霖）
「熱帶異貯型」的種子，不耐乾燥也不耐低溫。研究人員提醒，可可種子就屬於異貯型種子，含水量保持在30％以上，才能確保發芽，當含水量低於30％，發芽率就會開始降低，若低於15％，種子就不會發芽了；存放溫度也有條件，可可種子貯藏溫度過高或過低都不行，以15℃至25℃為佳，貯放環境溫度過高會使種子活性快速降低；若冷藏保存，隔天，種子就無法發芽，所以千萬不能冰冰箱，預備用於播種繁殖的可可種子，在剖果取得新鮮種子後，最好儘快播種完畢。
育苗用的盆器也挑規格，周佳霖解釋，可可有一深長主根，所以要選擇深度足夠的盆器，建議深度以30公分以上為佳，最淺不要小於15公分，否則易有盤根情形，會影響主根發育的結果，導致定植後容易發生倒伏，但盆器的寬度對可可苗影響不大。
以直播法育苗或種子直接催芽時，常有發芽不整齊與種子汙染的情形。（圖片提供／種苗場）
根據聯合國糧農組織FAO統計，2017年全球可可樹的種植面積超過1183萬公頃，產量約525萬公噸，主要生產國為象牙海岸、迦納、印尼、奈及利亞、巴西；至於我國可可樹的種植面積，周佳霖說，沒有太明確的統計，大約在150公頃至300公頃之間，以屏東種植面積最大，臺東、南投、彰化也種植了一些可可樹。
名牌巧克力多出自瑞士、比利時、日本這些不產可可豆的國家，周佳霖說，這些溫帶國家的精品巧克力大多為「原豆研製」的生產模式，進口可可豆再加工製成巧克力，但臺灣有適合的氣候及技術等條件，可建立「從樹到巧克力」的特殊生產體系，這也是屏東可可產業近年逐漸在國際間打開知名度的原因。
