與農地工廠息息相關的「工廠管理輔導法」部分條文修正草案，5月初通過立法院經濟委員會審議，28日朝野協商爭議條文，但沒有結果，針對立委蔡培慧特提出定工廠登記的落日條款、可相容於農業發展環境的特定登記工廠才可就地合法兩項修正動議，經委會召委賴瑞隆宣布，蔡培慧所提兩項修正動議併入未來的朝野協商中討論。
本會期只到5月底，28日既然無法完成工輔法的朝野協商，將來不及在這個會期三讀通過，地球公民基金會專員吳其融表示，如果有舉行臨時會的話，工輔法仍有可能在7月時三讀通過。
據農委會調查指出，目前農地工廠占用農地達1.4萬公頃。地球公民基金會認為如依行政院版的工輔法修正草案通過，農地工廠只要在3年內完成改善計畫書、取得特定工廠登記後，就可以就地合法、也代表特定工廠可以永遠在農地上生存。因此，環團委由立委蔡培慧提出工輔法修正動議。
蔡培慧的修正動議，包括針對行政院版的工輔法28條之5的「特定工廠登記」無落日限制，改為應在工廠管理輔導法公告後20年，「特定工廠登記」就會失效；也針對28條之10的「就地合法」條款，修正為「主管機關輔導媒合特定工廠組成協會，規劃2公頃至5公頃的鄉村型或在地型小型產業園區，如果是可相容於農業發展環境的特定登記工廠，才可辦理使用地變更。」
蔡培慧說明，28條之5原本沒有落日期限，修正動議加訂20年落日條款，修法通過實施20年後，如果工廠未能取得正式工廠登記，就無法繼續使用特定工廠登記營運；至於原本行政院版的就地合法條款，只要不是表列的中高汙染工廠就有可能繼續在農地上生存，她認為，中高汙染原本就應移至工業區，其餘的群聚性農地工廠也應規劃成小型產業園區、但不應擴大開發，至於就地合法的部分，她認為，應是如豆乾工廠等小規模的，可相容於農地的工廠，並應由農委會公告哪些工廠可相容於農地。
吳其融說，據統計，目前占用農地工廠，包括1萬公頃的特定農業區及4千公頃的一般農業區，如果這些農地變更成建地，除了環保團體不能接受，也難說服一般民眾。因此，即使照行政院版工輔法通過，環團仍會與各部會討論，哪些土地可以變更、哪些不能變更。至於後續會持續抗爭或呼籲？吳其融說，後續一定會有行動，但仍待討論。
