傳統裝蛋塑膠籃經常卡住雞糞、羽毛，食安風險大增，衛福部比對沙門氏菌患者和健康族群的雞蛋購買習慣，做流行病學研究，發現許多感染沙門氏菌的幼兒，家中都有購買散裝雞蛋的習慣，買散裝蛋感染沙門氏菌的風險機率，是健康族群的2.5倍，買盒裝蛋則沒有風險差異。可見目前散裝蛋品質堪慮，大人買散裝蛋，不知不覺把病菌都帶回家了。
為了防止禽流感病毒交叉傳播、提升食安，農委會要求生鮮禽蛋需使用一次性包材，24日正式上路，卻遭批評擾民，不過早在2014年，衛生福利部疾病管制署就研究過市售散裝蛋問題，分析51名感染沙門氏菌病患家中的雞蛋購買習慣，和3261名健康族群對照，結果發現病患家中大多有購買雞蛋。
研究患者有八成在7歲以下，其中購買盒裝蛋的家庭，感染沙門氏菌的風險，和一般健康的人沒兩樣，但若是一週內有購買散裝蛋，感染沙門氏菌的風險是健康族群的2.5倍，明顯增加。
沙門氏菌是生鮮產品重要的衛生指標，感染沙門氏菌會上吐下瀉、發燒，嚴重者引發菌血症，主因是吃到遭動物糞便污染的食物，2010年美國曾發生雞蛋沙門氏菌污染，有1939人因此生病，最終回收超過5億個雞蛋，各國無不致力降低沙門氏菌污染風險。
疾病管制署副署長莊人祥表示，實驗結果初步看來，購買散裝蛋的風險確實較高，未來還會再持續分析。站在公衛的立場，支持雞蛋改採一次性包材，降低禽場病毒交換可能，對民眾的健康較有保障。
散裝非洗選蛋，金黃色葡萄球菌也較高
無獨有偶，中興大學也曾研究市面上雞蛋的金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、大腸桿菌等等，傳統市場沒經過洗選的散裝蛋，有8％樣品被檢出金黃色葡萄球菌，比經過洗選的盒裝蛋高出許多，可能導致嘔吐、拉肚子。
農委會2012年就委託中興大學調查「新鮮殼蛋洗選與否之食媒性生物及蛋品品質差異分析與風險評估」，研究團隊到近20個傳統市場，購買未經水洗的散裝蛋，並到超市和賣場購買洗選蛋，同時檢測禽場剛出爐的雞蛋，當作基準參考。
在兩年的研究中，328件洗選蛋，有一件檢出金黃色葡萄球菌，比例僅0.3%；傳統市場114件散裝非洗選蛋，有9件驗出，比例達8%。沙門氏菌、大腸桿菌、彎曲桿菌則都沒檢出。
至於這些病原從哪裡來，報告中指出，可能是蛋商手中本來就有金黃色葡萄球菌，污染蛋品。農委會畜牧處家禽生產科科長李宜謙則說，雞隻糞便，以及塑膠裝蛋籠未清洗乾淨、交叉污染，都可能滋生病菌。
遠離污染源才有好蛋
這樣的結果並不表示洗選雞蛋一定最好，事實上，雞蛋到底要不要洗選，各國爭論已久，因為雞蛋水洗後，外殼的保護膜遭破壞，若沒有低溫冷藏、儘速食用，病菌反而容易入侵，美國規定洗選蛋必須存放在攝氏7度的環境。然而不論要不要水洗，世界各國都相當重視雞蛋整潔。也就是說，防止雞蛋產生食安問題，核心目標是遠離污染源，水洗與否只是手段差異。
以歐盟為例，歐盟不像日本、美國一樣洗選蛋，取而代之的是完整集蛋系統，設置專門集蛋箱、輸送帶，防止雞蛋生出來後沾染糞便。集蛋後，禽場會再輕拭蛋殼表面，確保沒有沾染雞糞和異物，送到一次性使用的紙盤或紙盒中，避免交叉感染。
此外，台灣農業標準學會秘書長、畜產專家廖震元表示，歐盟禽場還會訓練蛋雞在哪裡生蛋，若生在不恰當的地方，就把雞移到集蛋處，如此不斷重複，養成習慣後，雞就知道要到哪裡生蛋了。歐盟對於雞蛋每個環節都不放過，從前端就要求遠離污染源，因此即便沒有洗選，仍能保持一定的衛生安全。
李宜謙表示，沒洗選過的雞蛋，更應注意包材、清潔，例如擦拭外殼，剔除糞便，使用一次性的包材，降低病菌交叉傳染的機會。
防檢局局長黃㯖昌不諱言，使用一次性包材，應該和洗選雞蛋一起推動，但在消費者和業界還沒辦法完全接受、建立洗選設備的情況下，至少要從使用一次性包材開始。
他補充，曾有人質疑台灣並沒有大規模調查，證明蛋箱糞便可傳播病毒，「但這在全世界早已經是基本常識了」，禽流感病毒在常溫下可存活兩週， 用一次性包材，才能降低禽流感和其他病菌傳染風險。
廖震元說，用傳統塑膠籃裝雞蛋，根本不知道蛋商怎麼消毒、消毒水怎麼沖、運送車有沒有消毒，使用一次性包材雖然增加成本，「但這是應該的」，現在食品廠、餐廳的食安要求都升級了，只有蛋品還停留在30年前，若蛋雞產業倒了，蛋價會更貴。https://infogram.com/101-102-1g4qpzjxvndlm1yhttps://infogram.com/101-102-1g4qpzjxvndlm1yhttps://infogram.com/101-102-1g4qpzjxvndlm1y
