近年氣溫與雨量較往年變化來得大，對養殖戶的水質管理能力是一大考驗，文蛤又因屬濾食性的物種，受水質影響很大。水產試驗所發現出現大量死亡現象的文蛤池，很多是水質管理不佳，多數有弧菌爆量的問題，水試所最近找到能對抗弧菌的新殺手「短小芽胞桿菌D5」，把它添加在文蛤飼料裡再加上水質管理，就能把文蛤育成率從3成提升到6至7成，益生菌現已技轉給國內廠商。
根據水試所2015至2018年雲嘉南地區文蛤養殖環境調查，來自養殖戶主動送驗水質與獸醫到場採檢等案件，發現255場次的文蛤養殖池中，單純因水質不良而造成文蛤大量死亡的情形有129場次，占50%；另外100場次，約佔4成除了水質不良因素外，還有弧菌或革蘭氏陰性菌等病原菌感染，顯示水質管理是文蛤死亡最主要的因素。在實驗室中，以創傷弧菌、巴西弧菌的攻擊性最強，會讓文蛤死亡，而鰻弧菌與副溶血弧菌等則會讓文蛤變得虛弱；因此，若能管理好水質，再讓文蛤有對抗弧菌的能力，就有機會提高文蛤的育成率。
研究人員在培養皿上塗滿哈維氏弧菌 (Vibrio harveyi) ，在左下的圓孔中放入短小芽胞桿菌D5，可以發現紅圈處變透明，顯示短小芽胞桿菌D5分泌物質殺死弧菌的能力。（圖片提供／水產試驗所水產養殖組）
水試所水產養殖組研究員黃美瑩表示，2015年在白蝦腸道中分離出一株益生菌–短小芽胞桿菌D5，過去發現這隻益生菌會分泌物質殺死6種常見的弧菌，包含溶藻弧菌、鰻弧菌、霍亂弧菌、哈維氏弧菌、腸炎弧菌與創傷弧菌等，近期試驗把短小芽胞桿菌D5加入文蛤飼料，有效提升文蛤的抗弧菌能力，育成率跟著增加。
研究人員將短小芽胞桿菌D5添加於飼料中餵飼文蛤6個月，發現除了可以減少養殖池水弧菌的數量，降低池中有毒的總氨氮和硫化氫濃度，還能增強文蛤對抗弧菌的能力，若搭配良好的水質管理，可把文蛤的育成率從3成提高到6至7成。
除了試驗池的文蛤吃了有效，養殖池的白蝦也適用，這隻菌既然是從白蝦體內分離出來的，添加在白蝦飼料中也見效，近期黃美瑩也收到嘉義地區白蝦養殖戶反映，白蝦吃了添加短小芽胞桿菌D5的飼料後，明顯看到腸腺發展地不錯，提高育成率。
黃美瑩表示，雖然短小芽胞桿菌D5本身有殺死弧菌、讓水產動物有抗弧菌的能力，仍要搭配良好的養殖池管理才會有加乘效果，目前這隻菌已技轉給國內廠商量產，可望搭配其他益生菌應用於飼料中，文蛤養殖戶能受惠。
