中國6月10日片面暫停臺灣石斑魚輸銷，聲稱有2艘活魚運搬鉛的臺灣石斑魚藥檢不合格，農委會漁業署溯源回追石斑魚來源場11場，繼魚體確定沒有孔雀綠等禁藥殘留，今（17）日確定水質、底泥均未驗出四環黴素類、孔雀綠、結晶紫等藥物殘留，農委會主委陳吉仲表示，檢測數據將透過兩岸動植物檢疫平臺提供給中國，呼籲中國依同等標準提供科學證據。
中國上周指出，臺灣透過活魚運搬船輸銷至中國的石斑魚，被他們檢出有使用孔雀綠及結晶紫等禁藥，因此決定全面暫停臺灣石斑魚輸入，農委會第一時間回應上市石斑魚的抽查5年來沒有不合格案件，希望中國提出科學證據，至今未獲回應，漁業署經過回追石斑魚來源場，採取11場養殖場的魚體、池水、底泥後，確認這些來源場都沒有使用孔雀綠、結晶紫、四環黴素類等藥物。
陳吉仲表示，漁業署對魚貨來源11家養殖場進行採樣，分析養殖場內的魚體、底土及池水，結果顯示包含四環黴素類、孔雀綠、結晶紫等皆未檢出，已透過科學證據，證明我國輸出的石斑魚安全無虞，這些檢測數據農委會將透過兩岸動植物檢疫平臺提供給中方，也呼籲中方依同等標準提供科學證據。
漁業署強調，政府跨部會從生產到上市抽查把關，維護水產品食安，漁業署在生產階段、未上市前，歷年依風險程度辦理未上市水產品產地監測，絕大多數均合格，若有少數檢測出藥物殘留不符合規定，則限制移動至檢驗合格才能上市，呼籲國人安心消費國產水產品。
去年底中國也曾經指控臺灣出口至中國的石斑魚驗出孔雀綠，漁業署追查供應魚貨的養殖場，魚體、池水、底泥也都沒有驗出禁藥，地方政府因此建議，漁業署應在活魚運搬船出港前採檢魚體，以即時掌握外銷石斑魚的狀況。漁業署副署長林國平表示，在運搬船出港當下採檢魚體送驗，實驗室也需要時間才能取得採檢結果，但這是在管理上可以檢討精進的方向。
中國海關總署上周五通報臺灣輸銷中國的石斑魚檢出結晶紫，漁業署與地方政府一開始針對通報的2艘活魚運搬船登載於系統中的3場來源養殖場追查，結果3場養殖戶都說沒有供貨給這2艘活魚運搬業者，再經進一步追查，運搬業者才提供11家供貨來源場名單，漁業署對11家養殖場執行移動管制並採樣送驗。
對於活魚運搬業者涉嫌登載不實，是否依《漁船運搬養殖活魚管理辦法》開罰？林國平表示，此項行政調查工作會在檢驗工作告一段落後進行，若活魚運搬漁船及養殖場違反相關規定屬實，將依法裁處，現階段仍以確認魚體本身、池水及底泥等養殖環境沒有禁藥殘留為優先。
