傳統畜禽育種動輒耗費十年以上時間及大量人力成本，以基因檢測技術輔助育種約可節省3成成本，農業部畜產試驗所引進KASPTM檢測技術，相比PCR-RFLP分子檢測技術，可再節省4成時間及3成耗材成本。畜試所建置臺灣有色肉雞基因檢測平臺，協助業者進行候選基因與經濟性狀間的關聯性分析，成功發現可提升有色肉雞腿肉脂肪含量20%，以及讓不同周齡雞隻種蛋孵化率維持90%以上的有利基因型。
近年國際種畜禽品種選育公司多已應用「全基因組關聯性分析」方法作為種畜禽選拔標準，輔助育種，然而這種方法需要昂貴的研發投資，國內多數畜產業者無法負擔，農業部畜產試驗所因此從108年起引進螢光引子標記的競爭性交替基因特異性聚合酶鏈鎖反應（KASPTM）檢測技術，建置有色肉雞基因檢測平臺，協助業界遺傳選育工作。
KASPTM技術具有高通量、低錯誤率、低成本以及高效率等多項優點，國際上已多應用於玉米、小麥及大豆等多種作物的遺傳標記選拔。畜試所助理研究員朱家德表示，KASPTM檢測技術除具備基因型鑑別準確度外，相較以前分子生物檢測技術「聚合酶連鎖反應─限制酶片段長度多型性」（PCR-RFLP）還可節省工作時間約40%及耗材成本30%。
畜試所至今已協助中華民國養羊協會剔除造成努比亞山羊生長遲緩的黏多醣症基因型，協助坤諦生技公司發現可提升有色肉雞20%腿肉脂肪含量的有利基因型，讓雞腿口感提升、更富油脂香氣，也協助凱馨實業找到讓種雞雞蛋的孵化率維持90%以上的有利基因型。
朱家德指出，肉雞毛色、眼睛顏色等性狀特徵僅由少數幾個基因所調控，但像腿肉脂肪含量、種蛋孵化率等性能特徵，則是由上百個基因所調控，分析難度更高；畜試所以KASPTM技術做基因與經濟性狀的關聯性分析，會參考國外相關研究，再以國內有色肉雞品種做印證。
畜試所以KASPTM技術鑑定紅羽土雞等有色肉雞基因型。（圖片提供／畜試所）
畜試所協助中華民國養羊協會剔除造成努比亞山羊生長遲緩的黏多醣症基因型。（圖片提供／畜試所）
