衛福部食藥署辦理今年度「食品中戴奧辛抽驗專案」，抽驗到雲林縣「雲農畜牧場」名義的1屠體戴奧辛含量超過限量標準，確認超標後農業部通知雲林縣政府進行移動管制，問題羊肉未流入市面。並經現場訪視發現，問題羊肉雖以「雲農畜牧場」名義屠宰，但實際飼主為李姓飼主，李君開立健康聲明書疑似有冒用其他畜牧場之嫌，已移請檢調偵辦。
食藥署表示，食藥署7月6日赴雲林縣肉品市場，抽驗以雲林縣「雲農畜牧場」名義、於7 月1 日屠宰的羊肉，由雲林縣農政單位協助取得的保留樣本。食藥署7月22日因初驗結果顯示不合格，隨即於23日聯合農業部、環境部及地方政府展開調查，並在24日確認檢驗結果，戴奧辛含量檢出值每克脂肪4.6皮克（pg/g fat）、羊肉限值為2.5 pg/g fat；戴奧辛與戴奧辛類多氯聯苯含量總和檢出值為6.1 pg/g fat、羊肉限值為4.0 pg/g fat，已超出「食品含戴奧辛及多氯聯苯處理規範」所定限值。
食藥署表示，問題羊肉並未流入市面，嘉南羊乳因有使用到雲農牧場羊乳，已由衛福部預防性下架4公噸，相關風險已獲即時管控。
農業部23日會同食藥署、雲林縣府及畜產試驗所、農業藥物試驗所前往雲農畜牧場訪談及採樣，採檢雲農畜牧場飼料樣品11件、草料3件及生羊乳1件；但現場查核發現超標屠體原屬李君所有，因此也再李君住處採檢飼料樣品1件、草料樣品1件。
經環境部24日會同雲林縣府等單位現場勘查，羊隻飼養區域為水泥鋪面，未直接接觸土壤，畜牧用水則取自地下水，李君養羊處周邊1公里內雖無環境部列管的戴奧辛固定排放源，但環境部已啟動環境介質採樣調查工作，包括：鄰近養羊處地面土壤、飼養羊隻用地下水、以及現場環境空氣等，採集樣本進行戴奧辛檢驗，預計下周完成空氣、土壤與地下水檢驗，儘速釐清可能的戴奧辛來源。