米克拉颱風外圍環流及西南風造成「0625豪雨」至今（26）日下午雨勢趨緩，農業部下午召開「萬里溪堰塞湖災害緊急應變小組工作會議」，會中依據中央氣象署花蓮地區最新降雨預測，以及與會專家及地方政府意見，決議解除萬里溪堰塞湖黃色警戒，但仍請地方政府依保全戶名冊，密切與保全對象保持聯繫，以利後續再次執行疏散避難時，可快速啓動完成。
受到這波6月下旬豪雨影響，農業部彙整地方政府首波查報資料，截至今日下午5時，農業災損金額總計3,131萬元，災損情形以高雄市（占47%）、屏東縣（占30%）、桃園市（占20%）等地較為嚴重；其中農產損失2,048萬元，主要是木瓜、韭菜等作物，畜產損失507萬元、主要是雞，漁產損失574萬元、主要是淡水長腳蝦（俗稱泰國蝦）。
農業部部長陳駿季下午主持「萬里溪堰塞湖災害緊急應變小組工作會議」，依據林保署最新監測數據，萬里溪堰塞湖最大蓄水量可達420萬立方公尺，今日蓄水量為134萬立方公尺，依據中央氣象署定量降水預報，未來24／48小時預估累積雨量已分別下修為4毫米／18毫米，未達黃色警戒標準，且預估未來兩天也未達紅色警戒發布標準，因此於下午3時55分通報解除黃色警戒。
農業部林業及自然保育署預計於明日天候狀況允許下，進行投放投入式水位計，以利精確掌握湖水位與蓄水量變化，提供警戒發布重要情資。
農業部表示，黃色警戒解除後，後續仍將由地方政府持續精確掌握保全戶名冊，並與保全對象保持密切聯繫，以加速後續警戒發布時能快速啟動。同時，針對弱勢族群、防救災人力及交通運具，也須全面落實造冊列管，以利後續迅速執行預防性避難，確保應變機制即時到位。
會中農業部也提醒，雖然目前已解除萬里溪堰塞湖的黃色警戒，後續仍可能重新啟動黃色警戒與紅色警戒，請各權責機關持續檢視萬里溪沿線堤防、橋梁、道路、防護工程、收容安置處所、防汛物資及疏散撤離機制。