非洲豬瘟中央災害應變中心今（31）日完成臺中梧棲案例豬場病毒基因序列定序，確認為重組株，基因庫比對與流行中國、越南病毒相似度高達99.95%與99.92%。農業部獸醫研究所長鄧明中表示，與中、越重組株相似度高，但在中、越未公布最新案例病毒序列下，無法確認確切來源（國）是哪裡。公佈是善盡國際公民責任，透過比對才知跟哪一隻病毒株比較相似。
中央災害應變中心今日下午舉辦第43次會議會後記者會。鄧明中表示，定序只是證明病毒基因排列方式，但將序列解碼是否即可知病毒來源？比較大的困難是病毒會演化，舉例來說，序列相似度達99.95%，也就是1萬個裡面有5個不一樣，從這些不同之處，若可比對到來源國最新序列，當5個點都相似，就可以推論病毒是來源自哪裡，但若沒有這樣的資訊就很難說明可能的來源。
鄧明中說，我國將會把首例病毒序列資料提供世界動物衛生組織（WOAH）基因庫，讓其他國家也可相對取得這個資料，有類似疫情狀況就可以看出病毒的關聯性。
農業部動植物防疫檢疫署長杜麗華在記者會中表示，案例場在30日晚間徹底清消前，獸醫所再採檢36件樣品，檢出3件陽性，顯示現場清潔狀況確實不佳，「案場雜物多、糞便累積厚度高」；因非洲豬瘟病毒具高度保毒性、長期排毒等特性，可在環境中存活3個月，應變中心請求國軍協助，在專家指導下，與臺中市動保處共同清消，「目前仍在作業中」，總計已投入115名國軍。
鄧明中指出，30日晚間採檢36件樣品中，仍在大門口、冰箱內部及廚餘運輸車的踏板3處檢出病毒核酸陽性，顯示消毒未落實；因陳姓畜主住家即與豬場相連，將與專家討論後決定採樣是否加採畜主住家環境。