9月17、18兩日強震造成花東地區不少災情，包括花蓮金針花產區赤科山、六十石山道路崩塌毀損，農委會主委陳吉仲今（21）日上午視察赤科山產業道路10.5K處搶通情形，他表示，這次地震造成花東農業相關損失超過2億元以上，農委會水保局今、明兩天會將赤科山道路全部搶通，相關復建工程行政院將從速從寬支持，農民作物生產損失也會啟動現金救助。
水保局表示，強震後赤科山產業道路多處坍方，在公路總局支援搶通下，19日已搶通6.7K處，坍方體積最大、約1萬立方公尺的7.4K處正在搶通，預計明日上午可完成通車；此外10.5K處道路今日上午已搶通，工程單位下午繼續前往8.25K處搶通，此處同樣預計明日完成。
赤科山產業道路坍方嚴重。（圖片提供／水保局花蓮分局）
農委會主委陳吉仲今日前往赤科山10.5K處視察道路搶通情形。（圖片提供／水保局花蓮分局）
陳吉仲表示，小型的道路、水土保持工程，請水保局花蓮分局評估施作必要的臨時擋土或落石防護措施，以開口合約請廠商處理，整體的復健工程，則請公所與縣府會勘後提報行政院申請，院長已承諾相關經費需求從速從寬支持；花東共有13個糧倉受到震災毀損，農委會也會以最快方式，協助相關農會及民營業者申請設備更新，確保花東二期水稻收穫不受影響。
此次強震造成農業灌溉系統損壞嚴重，可能影響玉里地區3千多公頃農田這期耕作，陳吉仲說，農民生產作物因地震發生損失，農委會將公告啟動現金救助，玉里鎮及富里鄉農民「只要確認損失達20%就提供救助」；地震損壞灌溉系統部分，由水保局協助縣府及公所提報公共設施災後復建工程。今年花蓮金針產區因旱災減產，陳吉仲也指示水保局研議協助赤科山興建大型蓄水池。
