11月13日第1場反萊豬公投意見說明會中，農委會主委陳吉仲提出，萊豬不是食安議題，而是臺灣重要國際經貿議題。農委會前主委陳保基投書媒體認為萊豬就是食安議題，政府以加入跨太平洋夥伴全面進步協定（CPTPP）貿易規範包裝宣傳，是在欺騙國人。陳吉仲今（15）日做出回應，指出CPTPP要求會員國在食安與動植物防檢疫標準都要遵循國際規範，「我所講的都是事實，也有依據」。
陳保基投書表示，陳吉仲作為反萊豬公投反方代表，在意見說明會上迴避食安問題，一直以加入CPTPP需要遵循國際規範為由支持開放萊豬，是張飛打岳飛；美國並非CPTPP成員，反方怎麼能說拒絕美國要求會影響我國加入CPTPP，目前成員國中的紐西蘭及澳洲也拒絕萊牛；萊豬開放徒增國人食安風險，政府應該藉由這次公投解套。
陳吉仲今天上午出席2021年農業生態系服務研討會時回應，前主委陳保基說的「完全都不是事實！」陳吉仲舉例，前總統馬英九2012年開放含有萊克多巴胺的美國牛肉進來，到現在已經進口了40多萬公噸，每人每年吃了2.7公斤的美牛，比消費者平均可以吃到的美豬0.7公斤還多，這些都是事實。
下午出席農金獎頒獎典禮時，陳吉仲再次回應，CPTPP 11個會員國都允許含萊克多巴胺的豬肉進口，且CPTPP章節中已將遊戲規則中寫得很清楚，會員國在食品安全及動植物防疫檢疫措施上，應遵循國際規範，而萊克多巴胺的殘留容許量有CODEX於2012年7月5日通過的標準，因此目前全球有109個國家已開放萊豬進口，陳吉仲強調他所言都是事實，且有依據。
陳吉仲最後也不忘再次拉票，「現在是需要大家理性思考的時候，1218一起投不同意。」
