根據農業部林業及自然保育署監測資料，截至今（16）日下午2時20分，萬里溪堰塞湖蓄水量已達496.77萬立方公尺，約占總庫容97.4%，距離警戒水位高程剩不到1公尺，推估湖水位將在明日凌晨2時達到「紅色警戒」的水位高程，但因疏散撤離作業不適合凌晨執行，中央災害應變中心提前在今日下午3時發布「紅色警戒」，全面啟動強制疏散撤離作業。
中央災害應變中心今日下午2時召開萬里溪堰塞湖情資研判會議暨工作會報，依據中央氣象署雨量預報及湖區水位綜合研判，預計堰塞湖最快將在17日溢流。林業保育署今日下午3時發布「紅色警戒」，警戒對象與範圍包括花蓮萬榮鄉萬榮村、明利村及鳳林鎮森榮里、長橋里、山興里、鳳信里、大榮里、北林里等聚落。
應變中心指揮官季連成指示，紅色警戒發布，請農業部啟動CBS災防告警細胞廣播，另通知民防管制中心同步發布堰塞湖警報，進行村里廣播、警消車輛擴音及其他警報通知機制，並再次向民眾宣導防災意識，說明警戒發布原因，並提醒不得返回警戒區等事項。
中央災害應變中心表示，防災團隊研判堰塞湖將以溢流方式對壩體產生破壞，但破壞程度會因為壩體結構與土石堆積型態、河道型態、山區水文、地形等因素影響，具高度不確定性，無法具體預測。紅色警戒通報指出，目前壩體易受溢流水沖蝕而潰決，造成大量水體下移，恐危及溪床活動人員安全，建議相關單位進行河道管制，通知村民勿進入警戒區域及溪床活動。