臺北市政府7月1日起針對北農、北漁、北畜、花卉等4大公司及環南市場進行1萬多人的大規模PCR篩檢，第1天就篩出環南市場多達41人染疫，臺北市政府決定環南市場及附近的臺北家禽批發市場休市3天全面大清消，並與中央流行疫情指揮中心成立聯合前進指揮所，發布疫情警示簡訊並安排採檢。
臺北家禽批發市場休市期間，農委會將協調由其他縣市直接供應家禽屠體給臺北消費市場。因應臺北市環南市場疫情，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中、臺北市長柯文哲、農委會主委陳吉仲今（2）日上午至環南市場視察並討論相關措施。
柯文哲表示，針對市內幾個農漁畜產品批發市場快篩、打疫苗，在產生免疫力前，再做一次大規模PCR篩檢，北農篩檢出來確診案例不多，但環南市場的綑工等周邊工作人員確診案例多，而環南市場內的攤商才12例，北市府因此決定環南市場及家禽市場先停市三天，全面清消並靜置。
柯文哲指出，萬華地區之前已有2千人感染，現在是從社區進入批發市場，透過大規模PCR篩檢找出的確診者，確診者已隔離，今日下午5時前完成確診者疫調，明（3）日完成密切接觸者隔離並安排採檢，將大規模掃過三輪，希望把疫情控制下來，再過幾天就知道有無獲得控制。
陳吉仲補充，利用環南市場與臺北家禽市場休市3天的時間內，員工及承銷人約800人要完成PCR篩檢，自7月7日起跟北農一樣，須持PCR陰性證明，才能進入環南市場、家禽市場。
指揮中心與北市府今日成立聯合前進指揮所，並設置環南市場篩檢站，陳時中說，篩檢站就設在市場內方便相關人員可立即採檢，下午利用實聯制發布警訊簡訊，提醒這段時間內若有到過環南市場，有症狀者要跟衛生單位聯絡、迅速採檢，沒有症狀的也可以採檢，並將持續匡風險區域人員、安排定期採檢，篩檢站會持續設置，在周邊活動的民眾也可以來採檢。
因疫調需要一些時間，陳時中呼籲環南市場相關活動人員，包括管理單位所屬工作人員、外包人員、承租攤商人員、協助廠商人員等，都暫時不要移動，在家等待相關單位的聯繫，並配合疫調匡列與採檢安排。
環南市場與家禽市場休市3天，是否會對臺北市的民生物資供應造成影響？陳吉仲表示，北市所需1萬多隻家禽的供應量會協調新北家禽市場幫忙，也可由中南部產地就地屠宰後分切送到臺北消費地，維持民生物資供應穩定。
