內政部為了要有效管理土石方的流向，要業者在開挖、改建時先行處理，並訂定土石方的運輸車輛需要加裝GPS監控，也為土石方設置堆置場，並且也可以作為「回填農地」之用，但也造成業者反彈，抱怨處理成本增加，而這也是地方政府自治的權責，引起中央地方的抗衡。運輸車輛GPS監控、回收及堆置場、農用或非農用、業者自行處理、成本增加、地方政府權責，這些爭議是這幾日「土石方之亂」的關鍵字。
乍看下，十分有既視感，事實上前陣子的「廚餘之亂」，就上演過一模一樣的劇碼，環境部因為非洲豬瘟防疫，廚餘不能再養豬，「不能農用」，要求運輸廚餘的車輛要加裝GPS監控，並且緊急設立回收及掩埋和處置場，因為無法去化量能，業者要自行吸收處理費，導致成本增加，加上又是地方政府權責，造成縣市廚餘大戰。
事實上，從「廚餘之亂」到「土石方之亂」爭議的焦點，就是廚餘及土石方是否視為資源？抑或只是需要被去化的廢棄物？廚餘作為可以養豬的資源，只要做好管理，還是循環農業的良方；土石方作為可以改良農地的土壤，只要做好管理，甚至是資源永續的出路。反之，廚餘及土石方被視為廢棄物則要監控和去化，並且絕對不能再流入農業及農地。
而制度管理及人謀不臧，正是無法被當成資源的廢棄物最大的問題來源，近日臺南地檢署偵破一起農地濫倒廢棄土石方案件，看見的還是農地、魚塭變成廢棄土石方的棄置場。此次「土石方之亂」引起爭議，也因土石方可「回填農地」這去向，難免造成外界疑慮是否打開大門，讓農地遭殃。但內政部的政策初衷，原是要掌握土石方流向，視為資源的農土可以改善農地，無奈被解讀成將廢棄物的土石方回填農地，內政部及農業部一再重申，「農土農用、農地農用」，也希望土石方新制上路，真能做好流向管制，抑制廢土流竄傾倒，毀棄農田。