工廠管理輔導法一旦三讀通過，現有違章農地工廠可能取得合法地位，讓環保團體相當憂慮。環團22日再度針對農地工廠問題召開記者會，提出論述說明反對理由，農地上的違章工廠萬一發生火災，因救災相對不易，恐怕會危及周遭農地安全，因此農地上不宜設置工廠。農糧署主秘陳啟榮回應環團的疑慮，如果懷疑農地遭汙染，農業單位會依相關流程監測食用作物，協助農友保全證據，提供農民向工廠求償之用。
與農地工廠息息相關的《工廠管理輔導法》草案，日前在立法院初審通過，其中部份條文遭環保團體質疑，根本要讓農地工廠就地合法，不顧農地安全。環團指出，5月初台中后里一處農地上的廢輪胎工廠發生火災，延燒40小時才撲滅，大火燒這麼久，恐早已對鄰近農田造成污染。
環境權保障基金會專職律師郭鴻儀表示，台中市政府已針對該工廠開罰，但與其事後開罰、賠償，不如事前要求改善，但他認為，農地工廠如果透過修正後的工輔法取得特定工廠登記或變更地目，工廠仍會散落在農地，發生火災後仍會持續危害周遭的農地。
地球公民基金會專員吳其融說，以此次后里廢輪胎工廠延燒40小時，依建議應該用砂或土覆蓋滅火較佳，但一般農地工廠根本不會配置這樣的設備，他呼籲，應該把農地工廠移至有完善公共安全規劃的工業區中經營，落實農工分離，才能保障農地的安全使用。
交通大學土木系副教授單信瑜指出，農地工廠大多是鋼構的鐵皮屋，防火被覆不夠完善，內部往往未配置足夠的消防設備，一旦發生火災，擴大延燒的可能性較高，也因內部光線不良、動線不佳等問題，導致消防人員搶救風險較高，再加上農地工廠大多散落在農村，消防人力配置時未如工業區配置較完整，較少考慮到特種救災需求，都會增加防災與救災的成本。單信瑜認為，一旦工廠管理輔導法按現行通過委員會版本修正，農地工廠將會就地合法，防災、救災的成本將會更高。
台中市農業局局長蔡精強說，后里大火後，農業局隨即抽驗周遭農作物包括水稻、芋頭、高接梨、竹筍等，查看是否有遭受汙染情況，目前初步檢驗未超過食藥署的標準。
